基于反馈式条件随机场的G蛋白偶联受体拓扑计算预测方法

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专利号CN104732117B
申请日2015-04-02
专利类型: 未知
发明人陈**川
权利人苏*学 让权利人联系我
刘欢

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基本信息

基于反馈式条件随机场的G蛋白偶联受体拓扑计算预测方法
申请号 CN201510155276.1 分类号
申请日期 2015-04-02 有效期
公开日期 2018-02-13 公开号 CN104732117B
发明人/设计人 陈**川 权利人 苏*学
专利类型 未知 十象顾问 刘欢 联系TA

摘要介绍

本发明涉及一种基于反馈式条件随机场的G蛋白偶联受体拓扑计算预测方法,该预测方法包括:(1)数据集准备;(2)数据预处理;(3)反馈式条件随机场,包括三个阶段:(31)基本条件随机场模型,(32)反馈式条件随机场框架,(33)反馈机制与算法。本发明的GPCR的拓扑结构进行预测的方法是基于反馈式基本条件随机场模型(FCRF);基于条件随机场的联合概率模型,不需要对观察序列进行独立性假设,从而解决隐马尔可夫模型的局部最优问题;其次,本发明改进了基本条件随机场方法,引入了反馈机制,在不断的反馈中自我完善条件随机场的建模能力,从而最终提高GPCR拓扑的预测精度。

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